1. Любое сообщество (вернее — биоценоз) живых существ и его среда обитания, объединенные в единое функциональное целое, возникающее на основе взаимозависимости и причинно-следственных связей, существующих между отдельными экологическими компонентами. Выделяют микроэкосистемы (например, ствол гниющего дерева и тому подобное), мезоэкосистемы (лес, пруд и тому подобное) и макроэкосистемы (океан, континент и тому подобное). Глобальная экосистема одна — биосфера.
2. Синоним биогеоценоза. Биогеоценоз правильнее рассматривать как иерархически элементарную комплексную, то есть состоящую из биотопа и биоценоза, экосистему — своеобразную «клеточку» (по аналогии с клеточным строением организма) биосферы.
3. Информационно саморазвивающаяся, термодинамическая открытая совокупность биотических экологических компонентов и абиотических источников вещества и энергии, единство и функциональная связь которых в пределах характерного для определенного участка биосферы времени и пространства обеспечивают превышение на этом участке внутренних закономерных перемещений вещества, энергии и информации над внешним обменом (в том числе между соседними аналогичными совокупностями) и на основе этого неопределенно долгую саморегуляцию и саморазвитие целого под управляющим воздействием биотических и биогенных составляющих.